Familiäre Turbulenzen auf dem Gruberhof: Wie aus dem Nichts taucht nach 25 Jahren Ludwig Gruber auf, der Onkel von Martin und Hans. Er ist schwer krank und möchte sich mit der Familie aussöhnen. Während Hans und Lilli ihn mit offenen Armen empfangen, sind Martin und Lisbeth mehr als skeptisch - schließlich ist der Verdacht, Ludwig könnte den Tod von Martins Vater verschuldet haben, niemals aus der Welt geräumt worden. Und so stellt seine Rückkehr die Familie vor eine Zerreißprobe. Auch sein Liebesleben bereitet Martin Gruber immer wieder Kopfzerbrechen. Er fühlt sich zu der Apothekerin Franziska Hochstetter hingezogen, mit der sich allmählich eine Beziehung entwickelt. Doch auch Anne hat nach der Trennung weiterhin einen festen Platz in seinem Leben - sehr zu Franziskas Missfallen. So schwer es ihm fällt, der Bergdoktor muss sich zwischen den beiden Frauen entscheiden. Was dann geschieht, das hätte er sich in seinen tollkühnsten Träumen nicht ausmalen können. Die dramatischen Wendungen gefährden sogar die Zukunft des Gruberhofs.
Bei allen privaten Wirrungen ist Martin Gruber jedoch immer für seine Patienten da: Etwa für die Vierzehnjährige, die nur mit einer Blutspende ihrer leiblichen Eltern überleben kann. Doch die sind unbekannt ... Eine andere Patientin wird nach einer Hirnhautentzündung zur gespaltenen Persönlichkeit - und nur eine ihrer Identitäten verträgt die lebensnotwendigen Medikamente. Ein Feuerwehrmann hat den Alkohol gegen ein Helfersyndrom eingetauscht und kommt mit unerklärlichen Schmerzen zu Martin Gruber. Es sind bewegende Schicksale, die dem Bergdoktor fachlich wie persönlich alles abverlangen. Staffel 11: DVD 1 96. Höhenangst 97. Wunschträume 98. Finale Klarheit DVD 2 99. Lebensangst 100. Versehrte Seelen 101. Zwiespalt DVD 3 102. Phantomschmerzen 103. Getrennte Wege Staffel 12: DVD 1 104. Preis des Lebens (Winterspecial) 105. Ein neuer Anfang 106. Die Andere DVD 2 107. Schmerz 108. Dissonanzen 109. Ein ganzes Leben DVD 3 110. Zeit der Wölfe 111. Zeitenwende Staffel 13: DVD 1 112. Die dunkle Seite des Lichts (Winterspecial) 113. Zwei Wahrheiten 114. Déjà-vu DVD 2 115. Mutterlügen 116. Zeit des Erwachens 117. Die große Kälte DVD 3 118. Verlorene Seelen 119. Nur wir beide Staffel 14: DVD 1 120. Bauernopfer (Winterspecial) 121. Aus Mut gemacht DVD 2 122. Bis nichts mehr bleibt 123. Feind im Kopf DVD 3 124. Feuer 125. Bittere Tränen DVD 4 126. Atemlos 127. Tausendundein Tag 128. Alles anders Staffel 15: DVD 1 129. Special: Kalte Stille 130. Scheinwelten 131. Endlich Leben DVD 2 132. Hochspannung 133. Kontrollverlust 134. Extreme DVD 3 135. Im Frieden 136. Was bleibt Staffel 16: DVD 1 137. Paradies 138. Getrennte Welten 139. Eine schwere Last DVD 2 140. Wer wir sind 141. Im Netz 142. Spiel mit dem Feuer DVD 3 143. Neuland 144. Der Weg zurück